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重组腺相关病毒的制备

维真生物腺相关病毒包装采用的是经典的三质粒共转染法(Helper-free AAV包装系统,即AAV无辅助病毒系统),该系统包括3个载体和1株包装细胞:3个载体【载体质粒(含有目的基因表达盒,其两端是AAV2的反向末端重复序列)、包装质粒(反式提供具有AAV复制和包装功能的蛋白Rep和Cap)和辅助质粒(含有辅助病毒Ad5的重要元件E1a、E1b、E2a、E4等)】和1株包装细胞(HEK293T cell)。腺相关病毒包装的具体示意图如下:



维真生物重组腺相关病毒包装的具体示意图




1. 腺相关病毒重组载体构建

1) 根据客户实验目的和受试细胞选择不同的载体,在此以人源ORF为例。

2) 维真生物公司AAV载体的MCS区与人源ORF cDNA克隆现货库中的MCS区相兼容,可以通过简单酶切-连接-转化的方式将目的基因亚克隆至目标AAV表达载体,得到阳性克隆后通过测序以确认插入片段的正确性。


2. 细胞冻存

1) 按照细胞培养流程,将对数生长期的细胞吹下来加入50mL离心管中,200g离心5min。

2) 配制冻存液,90% 血清,10% DMSO,混匀。

3) 离心后去上清,将配制的冻存液加入,将细胞吹匀。

4) 取上述溶液每1mL分至1.5mL 细胞冻存管中,做好标记和日期。

5) 将冻存管放入装有异丙醇的冻存盒中,放入-80℃冰箱过夜。(冻存盒要提前一天从冰箱中拿至室温,使异丙醇的温度达到室温,每次冻存前确保异丙醇的加入量在刻度线上);

6) 第二天将冻存盒放入液氮或 -150℃冰箱中以长期保存;同时取一支细胞做复苏检测,以判断该批细胞的冻存质量。


3. 细胞复苏

1) 10cm dish中加10ml新鲜DMEM培养基,放培养箱预热至37℃。

2) 从液氮中取出冷冻管,迅速投入 37 ℃~38℃水浴中,使其融化(1-2 分钟左右)。

3) 待细胞冻存管中溶液融化后,200g离心5min,弃掉液体并吸取1ml预热的培养基将细胞沉淀轻轻吹起,转移到10cm dish中。

4) 摇晃均匀,置于培养箱培养。

5) 培养过夜,更换新鲜培养基(除去冻存液中DMSO对细胞的毒害作用)。


4. 细胞传代(以10cm dish为例)

1) 生物安全柜紫外灭菌半小时。

2) 灭菌期间,将DMEM培养基(含10%FBS,1%青链霉素混合液)和PBS置于37℃水浴锅中预热;0.25% 胰酶放置室温,不可水浴加热。

3) 取汇合度接近100%且活性较好的HEK293T 细胞,吸弃培养盘中培养基,加入约5mL,1×PBS,摇晃几下,吸弃PBS。

4) 加1mL 0.25% 胰酶在生物安全柜内消化约1min,室温低时可放置于培养箱中消化。消化时间不宜过长,否则影响细胞再次贴壁效率和活性。

5) 加入约5mL预热的培养基,终止消化。

6) 用移液管吹打均匀(吹打过程中不可用力过大,否则会吹破细胞),按照1:3的比例传代。各取2mL培养基至新的10cm dish中,再加入 8mL预热的DMEM 培养基。

注意:



传代盘数较多时,要先将预热的 DMEM 培养基加入到 10cm dish中,再加入含细胞的培养基,以避免细胞分布不均匀。置于培养箱前轻轻混匀dish中的培养基,使细胞均匀分散于培养基中。



5. AAV病毒包装(以10cm dish为例)

Day1:汇合度90%以上的HEK293T细胞按1:3比例传盘(每盘大约2.5× 106),培养基为Hyclone高糖DMEM培养基(含10%FBS)。

Day2:转染前1-2h左右,换成无血清培养基。

按照以下比例配制转染试剂:

Mix 1 体积μl Mix 2
DMEM(无FBS) 500μl DMEM(无FBS) 500μl
LTR-plasmid 5μg
VGF 60-70μl(1μg/μl) RC-plasmid 6μg
AAV-helper 10μg


Mix 1和Mix 2分别混合后,室温5-10min, 后将Mix 1和Mix 2混合,室温15-30min,逐滴加入至10cm dish中。(此时细胞汇合度在80%-90%比较适宜,细胞过少会影响转染效率)

Day3:质粒转染24h后,换新的无血清培养基。

Day5:转染72h收毒,将产毒的细胞连同培养基一起收集至50ml离心管中,离心,分别收获培养基上清与细胞沉淀:PEG8000沉淀培养基上清中的病毒;裂解细胞沉淀收毒;合并从细胞沉淀和上清中得到的AAV。


6. AAV 病毒纯化与浓缩

6.1 纯化——碘克沙醇密度梯度离心。

① 配制不同浓度的碘克沙醇;

② 取一个超离管,用电动移液器逐层、缓慢加入不同浓度的碘克沙醇;

③ 将处理好的病毒液加入到最上层;

④ 配平后超速,18℃、48000rpm、2.5h离心。

6.2 浓缩

① 离心完毕后,将超滤管底用针头刺破,收集腺相关病毒所在层至15mL管中;

② 将收集的病毒液注入浓缩柱中,加PBS+0.001%PF68至满,混匀;

③ 4000rpm,10℃,离心约1h。

④ 将超滤管中剩下的液体反复吹打后吸至病毒储存管中,最后加入病毒储存液,标明名称和日期。

⑤ 将收集起来的病毒涡旋震荡混匀后离心,吸 10μL 病毒液进行滴度检测。


7. 病毒滴度检测方法

实时定量PCR法是一种简单的、高通量的测定纯化病毒样本中腺相关病毒颗粒数量的方法。每个模板的Ct值与该模板起始拷贝数的对数存在线性关系,利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析。

7.1 去除游离DNA分子

先将病毒稀释10倍,以保证样品中游离的DNA充分降解:取5μl病毒至45μl PBS缓冲液中,充分混匀。按以下体系配制Mixture:

组成成分 体积
超纯水(DNase & RNase Free) 4 μl
DNAaseI 1 μl
10×DNAaseI Buffer 1 μl
病毒稀释液 4μl
Total 10μl

37 ℃ 孵育 30 min,95℃加热 5min 使 DNA 酶失活。

7.2 去除病毒蛋白外壳

向上述体系中再加入 1μl 蛋白酶 K(5μg/μl)。37 ℃ 孵育 30 min;再加30ul超纯水稀释至40ul(至此病毒原液稀释100倍),95℃加热 5 min使蛋白酶 K 失活,然后 12000rpm,离心 2min,取上清进行 qPCR 检测。

37 ℃ 孵育 30 min,95℃加热 5min 使 DNA 酶失活。

7.3 qPCR

将步骤2得到的上清,取 5μl 进行 10 倍梯度稀释,即病毒原液稀释了 1000 倍。分别取 2μl 待测样品及标准品作为模板进行 qPCR 检测。

qPCR反应体系如下:

组成成分 体积
2 × SYBR Green mix 10 μl
Primers (Forward & Reverse mixture) 0.8 μl
超纯水(DNase & RNase Free) 7.2μl
DNA 2μl
Total 20μl

qPCR反应程序:

循环参数
预变性95℃ 3min
95℃ 5S
60℃ 15S
72℃ 15S+Plate Read
39个循环


7.4 数据分析

病毒颗粒数的计算:病毒颗粒数(VP/mL) = 与标准品相对值×1000


附件1:载体选择


基因过表达








基因沉默







基因编辑




附表2:耗材


耗材名称 货号 品牌
细胞培养板 10cm 704001 NEST
细胞培养板 15cm 715001 NEST
10ml血清移液管 4488 Corning
50ml血清移液管 4490 Corning
100-1250无菌加长带刻度滤芯枪头 TF112-1000-Q QSP
细胞冻存管 377267 Corning
DMEM高糖培养基 C11965500BT GIBICO
HEPES溶液 1M SH30237.01 HyClone
青霉素-链霉素溶液(100*) C0222 碧云天
胎牛血清 1122050 Gibico
0.25%胰蛋白酶 SH30042.01 Hyclone
10xPBS ST476 碧云天
DMSO D8372 SOLARBIO


附表3:仪器


仪器名称 规格型号 品牌
生物安全柜 BSC-1300IIA2 苏净集团苏州安泰空气技术有限公司
倒置显微镜 CKX31SF OLYMPUS
实时荧光定量扩增仪(QPCR仪) CFX96 BIO-RAD
荧光显微镜 ELWD0.3 Nikon
超低温保存箱 DW-86L386 青岛海尔特种仪器有限公司
台式高速冷冻离心机 1580R LAB GENE 基因有限公司


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